医学代谢组学
医学代谢组学是顺利获得代谢组学的方法研究内外在因素影响下人体代谢组整体的变化轨迹,进而揭示某种病理或生理过程的机制中发生的一系列变化,在基因解析、病理阐述、药物设计开发、病变标记物筛选、疾病诊断及分型,以及治疗效果的预测等医学相关领域得到了广泛研究和应用。
医学代谢组学利用高通量的分子监测技术筛选与疾病相关的生物标志物,为疾病发生的病理学机理研究及动态监测给予了新的思路,是现在最为先进的精准医疗诊断策略,其诊断分析结果是现在所有精准医疗策略中与疾病发生相关性最高的。
»医学代谢物组学研究的意义
©每种重要的生物分子都有组学,代谢组学联合基因组学、转录组学、蛋白质组学可以从不同层面、不同角度给予对细胞生理活动的更加深入全面的阐述
©代谢组学是基因组学、转录组学和蛋白质组学的自然延伸,是最接近表型的组学科研;
©小分子代谢物作为蛋白质的辅助因子或信号分子,与蛋白质的功能紧密相关;
©95%的医学诊断检测的是小分子代谢物;
©89%的已知药物是小分子代谢物或衍生物;
©50%的药物以小分子代谢物为前体;
©30%遗传疾病与小分子代谢失调相关;
医学非靶向代谢组学
非靶向代谢组学是以组学为视角无偏向性地检测所有内源小分子代谢物,顺利获得生物信息学分析,研究生物体在不同状态下内源小分子代谢物的整体代谢特征和变化规律,发现导致代谢差异的代谢物、潜在生物标记物和相关代谢通路。非靶向代谢组学的大规模无偏向筛选可用于疾病的早期诊断和分型,是精准医学的重要技术手段之一。
»数据处理及结果分析
专业的分析人员和数据处理流程,对组学数据进行主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)、正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)、T-检验,差异代谢物火山图、热图、相关性以及代谢通路等分析,给予翔实可靠的分析结果。
»技术优势
1.丰富的项目经验:
样本处理经验丰富,已完成项目涵盖血浆、血清、尿液、组织、肠道内容物、粪便、唾液、培养液、微生物、植物样本等;
2.专业的检测及分析能力:
严格的质量控制体系,配合超高分辨的Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM LumosTM TribridTM 三合一超高效液相色谱-质谱系统,以及专业的数据处理及分析能力,给予数据预处理、代谢物鉴定、统计分析、代谢通路分析等一站式解决方案。
»典型应用方向
1、寻找疾病生物标记物;
2、疾病诊断分型、疾病机理和发病机制,以及个性化治疗方案等;
3、新药研发、药效评价、药物毒理及安全性评价;
4、中药方证代谢组学研究,评估中医中药的疗效和安全性;
医学靶向代谢组学
靶向代谢组学(Quantitative metabolomics)是针对具体代谢通路或者具有相似功能的一类内源性小分子化合物进行检测的代谢组学方法,借助定量代谢组学平台,对靶向代谢物进行精确定量。利用此技术,可以为生物标志物的深入研究和开发利用给予有力支持,并最终用于疾病机理研究,疾病诊断和治疗及药物靶点发现。
»优势分析项目
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短链脂肪酸 游离脂肪酸 胆汁酸 氨基酸 神经递质 氧化三甲胺及其代谢物
6种短链脂肪酸
在机体消化、肠道健康、病原菌抑制等方面发挥这重要的作用;
与代谢综合征(脂质代谢、肥胖、糖尿病、心血管疾病等),肿瘤,炎症等疾病紧密相关。 50多种游离脂肪酸
脂肪酸代谢受胰岛素和胰高血糖素等激素的调控;
与代谢综合征(脂质代谢、肥胖、糖尿病、心血管疾病等),肿瘤,炎症等疾病紧密相关。 16种胆汁酸
促进消化吸收,调节胆汁酸代谢、脂质代谢、糖代谢,参与免疫过程等多种重要的生物学功能,是肠道微生物研究的焦点之一;
肝胆疾病、胃肠道疾病、代谢性疾病的病理机制研究。 47种氨基酸及其衍生物;
与能量代谢、免疫调控、内分泌调节、信号传导等生物过程密切相关;
与肿瘤、心血管疾病、代谢性疾病、神经系统疾病等密切相关。 24种神经递质
与学习记忆、生物节律等机体调节功能中发挥着十分重要的作用;
已证实神经递质失调与多种神经疾病密切相关,如帕金森、精神分裂、阿尔兹海默、肌无力、焦虑、抑郁、癫痫等 5种氧化三甲胺
在机体渗透压调压、细胞内稳态维持、细胞分裂等方面都具有极其重要的作用;
研究表明氧化三甲胺水平升高与心血管疾病、高血压、心功能不全、动脉硬化、心肌梗死、慢性肾病等多种疾病密切相关。
»特色分析项目
26大类,500多种内源性代谢物的绝对定量。
技术路线
»技术优势
1.个性化的实验方案:
根据样本种类选择不同的前处理方法,优化色谱分离、质谱条件等,对代谢物进行针对性检测,极大提高检测的灵敏度、准确性、特异性及重现性,从而对代谢物进行绝对定量研究,实现代谢物的信息挖掘。
2.卓越的高通量定性定量能力:
高分辨质谱,结合丰富的标准品库,一针进样,可同时实现26大类,500多种内源性代谢物的绝对定量。
3.检测项目的广泛覆盖:
医学靶向检测项目覆盖脂肪酸、胆汁酸、氨基酸、神经递质、氧化三甲胺等26大类内源性代谢物;
4.专业的检测及分析能力:
严格的质量控制体系,配合超高分辨的ThermoScientificTM Orbitrap FusionTM LumosTM TribridTM 三合一超高效液相色谱-质谱系统,以及专业的数据预处理及分析能力,为数据的可靠性、准性保驾护航。。
医学脂质组学
脂质组学(lipidomics)是“代谢组学”的一个分支,是对生物体、组织或细胞中的脂质以及与其相互作用的分子进行全面系统的分析、鉴定脂质的结构和功能,进而揭示脂质代谢与细胞、器官乃至机体的生理、病理过程之间的关系的一门学科。现在脂质组学已经被广泛运用于药物研发、分子生理学、分子病理学、功能基因组学、营养学以及环境与健康等重要领域。
脂质大体分为八大类:
1.脂肪酸类(fatty acids)
2.甘油脂类(glycerolipids)
3.甘油磷脂类(glycerophospholipids)
4.鞘脂类(sphingolipids)
5.固醇脂类(sterol lipids)
6.孕烯醇酮脂类(prenol lipids)
7.糖脂类(saccharolipids)
8.多聚乙烯类(polyketides)
»脂质组学研究技术
主要包括脂质提取、分离、分析鉴定以及生物信息学分析,现在已经建立的脂质分析方法包括薄层色谱法(TLC)、气相色谱质谱联用(GC-MS)、液相色谱质谱联用(LC-MS)、电喷雾电离质谱法(ESI-MS)和核磁共振法(NMR)等。
»技术优势
1.丰富的样本前处理经验:
样本前处理经验丰富,已完成项目涵盖血浆、血清、尿液、组织、肠道内容物、粪便、唾液、培养液、微生物、植物样本等;
2.卓越的定性定量能力:
自主构建脂质代谢物的数据库,包含34类,76361种脂类物质,181300张MS/MS二级质谱图定性定量上千种脂质,检测成果重复性高,确保检测准确性;
3.专业的检测及分析能力:
严格的质量控制体系,配合超高分辨的Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM LumosTM TribridTM 三合一超高效液相色谱-质谱系统,以及专业的数据预处理及分析能力,给予数据预处理、代谢物鉴定、统计分析、代谢通路分析等一站式解决方案。
»样本要求
植物组织 200-500 mg/sample
动物及临床组织标本 200 mg/sample
血清、血浆 200 μL/sample
微生物、细胞 1×107 cells/sample
尿液 1 mL/sample
粪便/肠道内容物 200 mg/sample
培养液 200 μL/sample
»生物学重复
样本数量:植物和微生物n≥3,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析。
常规项目周期
实验检测:15个工作日(从收到客户预付款并收到样品之日起)
数据分析:5个工作日
»仪器设备
Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM LumosTM TribridTM三合一质谱仪
Thermo Scientific™ Q Exactive™ HF 组合型四极杆 Orbitrap质谱仪